Los criadores de caballos son capaces de predecir la coloración de los potros con el conocimiento de los genes dominantes y recesivos que determinan el color. Un caballo tiene dos copias de cada gen. Los rasgos recesivos sólo se expresan si ambas copias del gen son recesivas. Si una o ambas copias son dominantes, se expresa el rasgo dominante.

Blanco

El alelo dominante del gen W previene la pigmentación de la piel y el cabello. Un caballo con una copia dominante del gen W tiene pelo blanco, ojos marrones o azules y piel rosada. Otros caballos tienen dos copias del gen W recesivo. El gen W es letal si ambas copias del gen son dominantes.

vive un caballo salvaje en una manada

Gris

La coloración del gris está determinada por el gen G. Si un caballo tiene una o dos copias del gen G dominante, será de color gris. Los caballos con este gen no nacen grises, pero su pelo se vuelve gris cuando crecen. A diferencia de los caballos blancos, los grises tienen la piel pigmentada. Los caballos que no son grises tienen dos copias recesivas del gen G.

Negro

El pelo negro está determinado por dos genes; A y E. El gen E determina si el caballo tiene pigmentación negra en el pelo. Un caballo sin pigmentación negra tiene dos copias recesivas del gen E y es de color rojo. El color rojo incluye castañas y acederas y las crines y cuentos son también un tono de rojo, pero no de negro. El gen A determina cómo se distribuye el pelo negro en el cuerpo. Los caballos uniformemente negros tienen dos copias recesivas del gen A. Si un caballo tiene una o dos copias del gen A dominante, puede tener puntos negros en las patas, crin y cola, pero no un pelaje negro en el cuerpo.

Dilución

Los genes C y D diluyen la pigmentación de los caballos a un color más claro. El gen C sólo diluye la pigmentación roja y no tiene efecto en la coloración negra. Si un caballo rojo tiene dos copias dominantes de este gen, el pigmento rojo no se diluye. Si un caballo tiene una copia dominante y otra recesiva del gen, el color se diluye. Esto hace que los caballos de la bahía se conviertan en caballos de batalla y que los caballos rojos se conviertan en palominos. Los caballos con dos copias recesivas de este gen son cremelones, un color crema pálido con ojos azules y piel rosada.

El gen D afecta tanto a la pigmentación roja como a la negra, pero no afecta a la coloración en las puntas del caballo. Este gen no está presente en todas las razas. Los caballos con dos copias recesivas del gen D se convierten en “duns”. Esto da lugar a que los caballos rojos se diluyan en dunas rojas, los caballos de laurel en dunas de piel de buccino y los caballos negros en dunas de ratón o grulla.

Otros genes de color

Los caballos de la pintura tienen el gen tobiano o TO. Los caballos con al menos una copia dominante de este gen tienen un patrón de pelo blanco que suele incluir patas blancas, una cabeza oscura y un patrón variable en el cuerpo. Si un caballo tiene dos copias dominantes de este gen, siempre producirá potros manchados. Los genes responsables de otras manchas y patrones blancos, incluyendo la apaloosa y las marcas blancas, son todavía desconocidos.